海南火车过海主要有两种方式：汽车渡轮和海底隧道。
1. 汽车渡轮：从海南岛的海口市搭乘汽车渡轮前往广东省的湛江市或珠海市。乘坐汽车渡轮需要先将火车转移到海口港或其它港口，并将火车上的乘客和货物转移到渡轮上，然后通过海峡横渡至对岸。在对岸再将乘客和货物重新转移到陆地上的火车上。
2. 海底隧道：目前正在规划建设海南岛与广东省之间的海底隧道，预计将建成后，火车可以直接通过海底隧道往返于两地。海底隧道是一种在海底铺设的隧道，可以让列车穿越海底，实现陆地与岛屿之间的连接。这种方式可以大大减少过海的时间和风险。
目前，海南火车过海主要还是依靠汽车渡轮，但海底隧道的建设将为海南火车过海提供一个更加便捷和高效的交通方式。
