1、人们对于两者所指的性别认识不同：
（1）妖精，也许受到《封神演义》中的妲己影响，妲己是千年狐妖所变化，已经成为“狐狸精”的代名词。所以会惯性认为妖精一般都是女的，比如《西游记》中，白骨精也是女妖精。
（2）妖怪，受《西游记》的影响，都是一些长相奇特的雄性生物，所以也会惯性认为妖怪一般是男的。
（3）但是，在欧洲的传说里，妖精和妖怪都被翻译成“精灵”和“怪物”。它是不分雌雄的。
2、修炼成形的物种不同：
（1）妖精：一般是草木或者小动物修炼而成，比较偏向于大自然物质的化身。比如在封神演义中的千里眼和顺风耳，就是桃树和柳树吸收轩辕庙的灵气，幻化成精怪的。
（2）妖怪：一般是指那些野兽化成人形，修炼有成的生物，是凶猛的异兽修炼，狰狞恐怖，法力高深。
3、解释不同：
（1）妖怪：是指除人类和神以外存在于天地中的超自然生命，即由于认知限制，人们暂时难以以科学解释的现象或事物，
（2）妖精：比较偏向大自然事物化身，会愚弄人类的神怪。
